18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_04631 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  100 
 
 
103 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1746  thioredoxin family protein  96.12 
 
 
103 aa  195  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21141  thioredoxin family protein  43.62 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  48.91 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  46.94 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04731  thioredoxin family protein  46.94 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  51.65 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0407  hypothetical protein  44.9 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04621  thioredoxin family protein  44.9 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  40.82 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  38.04 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  39.56 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  40.91 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  36.96 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  36.96 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  33.33 
 
 
87 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  32.81 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>