26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1485 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  58.82 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  56.79 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  54.22 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4055  glutaredoxin 2  54.32 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  48.84 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  56.98 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  45.56 
 
 		 91 aa  83.6  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  40 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  43.68 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  40 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  40.79 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  35.59 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  42.11 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  34.62 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  43.1 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35557  predicted protein  40 
 
 		 158 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.356085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  37.1 
 
 		 78 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  38.16 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  40 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27670  predicted protein  31.58 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  35.09 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  34.38 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  41.18 
 
 		 83 aa  40  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  25 
 
 		 100 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  31.25 
 
 		 77 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>