21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4055 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4055  glutaredoxin 2  100 
 
 
87 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  93.1 
 
 
87 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  65.12 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  66.67 
 
 
84 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  59.34 
 
 
91 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  60.23 
 
 
95 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  56.63 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  54.32 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  40 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  40.79 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  38.89 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  39.34 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  30.93 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27670  predicted protein  33.33 
 
 
166 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  36.56 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  35.29 
 
 
78 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21141  thioredoxin family protein  32.97 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  37.7 
 
 
79 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  38.46 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35557  predicted protein  40.38 
 
 
158 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.356085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>