62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1088 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  60.76 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  49.33 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  44.59 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  46.75 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  45.45 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  45.95 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  45.95 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  45.95 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  45.95 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  45.95 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  44.59 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  43.24 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  44 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  44.93 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  44.12 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  40.54 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  44.16 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  40.54 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  40.54 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  40.54 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  49.18 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  35.9 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  35.53 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  36.49 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  38.67 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  45.21 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  39.74 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  40 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  41.1 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  31.34 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  34.85 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  38.36 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  35.06 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  39.29 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  31.08 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  31.08 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  38.36 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  34.21 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  33.93 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1264  glutaredoxin 2  36.99 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.605102  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  38.46 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  35.82 
 
 		 83 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  27.27 
 
 		 89 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  36 
 
 		 80 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  45.1 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  34.67 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  35.14 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  32.81 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  41.67 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  41.67 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  34.25 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1746  thioredoxin family protein  34.43 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  32.89 
 
 		 81 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  37.65 
 
 		 88 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>