57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3278 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  100 
 
 
81 aa  158  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  62.34 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  48 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  40.74 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  32.47 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  41.89 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  38.96 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  41.25 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  41.56 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  38.16 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  40.3 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  36.84 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  43.42 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  38.75 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  40.51 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  39.74 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  40.26 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  40.96 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4374  glutaredoxin 2  36.49 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  39.24 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  40 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  36.49 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  40 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  32.5 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  36.25 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  36.25 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  32.91 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  30 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  36.71 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  32.91 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  36 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  31.65 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  37.35 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  37.84 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  36 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  36 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  35.06 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  35.06 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  34.67 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0675  glutaredoxin 2  33.73 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  36.99 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  34.67 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  34.21 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  35.9 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0688  glutaredoxin 2  33.73 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.221037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  34.33 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  36.99 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  36.99 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  36.99 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0668  glutaredoxin 2  33.73 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.92813  normal  0.901125 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  34.21 
 
 
78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  36.99 
 
 
80 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  36.59 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  32.05 
 
 
87 aa  41.2  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  30.43 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  32.89 
 
 
80 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  35.82 
 
 
87 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>