69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0688 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0668  glutaredoxin 2  100 
 
 
84 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.92813  normal  0.901125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0688  glutaredoxin 2  100 
 
 
84 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.221037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0675  glutaredoxin 2  100 
 
 
84 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  65.06 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1011  glutaredoxin 2  67.95 
 
 
87 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  53.01 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0068  glutaredoxin 2  74.39 
 
 
84 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0187457  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  58.54 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  56.96 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  53.09 
 
 
78 aa  84.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  46.25 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  46.15 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  38.75 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  44.19 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  48 
 
 
103 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  45.78 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  42.67 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  38.27 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  45.57 
 
 
79 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0259  glutaredoxin 2  43.21 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  43.06 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  35.44 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  36.71 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  46.67 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4374  glutaredoxin 2  35.44 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  40.51 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  32.14 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  36.71 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  36.49 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  32.93 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  35.9 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  31.58 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  38.36 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  33.73 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  31.58 
 
 
86 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  39.24 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  35.71 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  34.18 
 
 
80 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  37.33 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  37.33 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  37.33 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  38.96 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  39.74 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  40.26 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  37.33 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  28.75 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  37.97 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18000  glutaredoxin 2  29.73 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  37.7 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  36.71 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  28.57 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  36.71 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  35.21 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  34.67 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  33.85 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  35.44 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  35.44 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  35.9 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  35.44 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  35.44 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  35.44 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  35.44 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  29.49 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  40.98 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  27.16 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  26.44 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  33.33 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5697  glutaredoxin family protein  34.33 
 
 
81 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.411683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>