40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2316 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  100 
 
 
86 aa  174  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  60.81 
 
 
80 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  52.05 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  57.58 
 
 
87 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  47.06 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  52.31 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  45.33 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  45.33 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  44 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  45.33 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  44 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  44 
 
 
78 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  44 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  44 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  44 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  40.96 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  41.67 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  40.48 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  37.33 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  41.56 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  39.24 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  35.62 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  33.33 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  34.62 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  36 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  29.58 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  36.49 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  32.5 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  28.99 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  34.21 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  36.84 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  34.67 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  40.68 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  30.26 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  30.67 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>