50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0729 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  100 
 
 		 87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  47.95 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  53.85 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  47.27 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  45.31 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  45.07 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  44.62 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  48.33 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  50 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1264  glutaredoxin 2  42.19 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.605102  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  45.61 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  44.64 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  48.08 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  47.27 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  45.45 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  43.64 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  35.71 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  38.18 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  37.68 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  47.27 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  41.51 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  41.82 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  42.11 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  44.64 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  41.82 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  38.98 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  48.98 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  43.86 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  45.76 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  42.11 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  40.68 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  48 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  36.84 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  41.27 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1011  glutaredoxin 2  43.48 
 
 		 87 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  40.35 
 
 		 80 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  40.38 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  40 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  38.46 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  41.3 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  40 
 
 		 80 aa  40  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>