76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2902 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  100 
 
 		 87 aa  173  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  87.32 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  73.17 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  60.71 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  59.52 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  63.16 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  60.53 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  61.84 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  61.84 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  61.84 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  62.67 
 
 		 80 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  60.53 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  60.26 
 
 		 80 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  62.16 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  51.16 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  50.57 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  52.33 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  57.33 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  55.38 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  45.68 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0259  glutaredoxin 2  44.3 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  44.16 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  41.33 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  41.77 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  41.03 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  36.36 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  38.75 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  41.18 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  38.27 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  40 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  38.67 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  44.87 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  43.21 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  40.85 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  45.21 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  38.36 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  37.18 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1011  glutaredoxin 2  36.9 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  35.44 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  30.56 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  38.67 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  41.1 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  37.84 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  40.24 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  34.25 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  36.99 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  35.44 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  33.75 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  32.88 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  34.25 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  30.77 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  37.68 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  37.68 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  38.03 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  35.06 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  39.29 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0675  glutaredoxin 2  35.44 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0688  glutaredoxin 2  35.44 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.221037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0668  glutaredoxin 2  35.44 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.92813  normal  0.901125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  44.44 
 
 		 90 aa  42  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  40.79 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  36.99 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  36.49 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  37.84 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  32.47 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  35.14 
 
 		 79 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4374  glutaredoxin 2  30.77 
 
 		 88 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>