72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0259 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0259  glutaredoxin 2  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  76.25 
 
 
82 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  64 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  56.41 
 
 
95 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  59.21 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  54.79 
 
 
93 aa  90.5  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  51.35 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  54.05 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  50 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  52.7 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  51.85 
 
 
92 aa  83.6  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  45.33 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  48 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  48 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4374  glutaredoxin 2  48 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  44 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  45.78 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  41.56 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  46.84 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  42.68 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  45.45 
 
 
80 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  46.25 
 
 
87 aa  72  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  41.98 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  45.95 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  45.95 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18000  glutaredoxin 2  47.14 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  45.95 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  47.14 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1011  glutaredoxin 2  42.22 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  44.59 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  47.95 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  48.86 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0688  glutaredoxin 2  43.21 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.221037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0668  glutaredoxin 2  43.21 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.92813  normal  0.901125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0675  glutaredoxin 2  43.21 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  42.5 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  47.37 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  47.95 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  47.95 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  47.95 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  46.05 
 
 
84 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  47.95 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  46.05 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  47.95 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  41.56 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  43.42 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  38.96 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  46.58 
 
 
78 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  41.54 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  40.91 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  36.25 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  34.67 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  41.1 
 
 
81 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0068  glutaredoxin 2  40.24 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0187457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  32.89 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  33.33 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3684  glutaredoxin 2  38.71 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.796183  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  37.5 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5697  glutaredoxin family protein  36.92 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.411683  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  42.31 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4830  glutaredoxin family protein  36.92 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4820  glutaredoxin family protein  36.92 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5255  glutaredoxin family protein  36.92 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5290  glutaredoxin family protein  36.92 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.291889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5244  glutaredoxin family protein  36.92 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  35.09 
 
 
89 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  34.21 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35557  predicted protein  32.61 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.356085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>