59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0666 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1011  glutaredoxin 2  62.35 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  57.32 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0668  glutaredoxin 2  51.85 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.92813  normal  0.901125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  50.62 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0688  glutaredoxin 2  51.85 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.221037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0675  glutaredoxin 2  51.85 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  45.78 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  55 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0068  glutaredoxin 2  59.52 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0187457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  46.34 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  46.91 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  46.91 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  42.68 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  45.12 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  51.22 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  46.34 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  41.57 
 
 		 82 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  42.17 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0259  glutaredoxin 2  45.98 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  40 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  38.37 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  36.14 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  40.26 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  39.47 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  36.84 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  40.96 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  36.25 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  36.36 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4374  glutaredoxin 2  36.59 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  40.26 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  39.02 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  37.8 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  39.02 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  40.96 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  37.8 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  37.8 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  39.02 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  39.02 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  36.78 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  38.27 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  32.91 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  38.46 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  36.59 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  31.71 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18000  glutaredoxin 2  37.66 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  32.91 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  30 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  36.99 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5697  glutaredoxin family protein  29.17 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.411683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  37.68 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  37.65 
 
 		 80 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3684  glutaredoxin 2  29.41 
 
 		 81 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.796183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>