70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4243 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  100 
 
 
80 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  98.72 
 
 
78 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  97.44 
 
 
78 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  97.44 
 
 
78 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  91.03 
 
 
78 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  87.18 
 
 
78 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  85.9 
 
 
78 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  85.14 
 
 
84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  85.14 
 
 
84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  85.14 
 
 
84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  85.14 
 
 
84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  85.14 
 
 
84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  85.14 
 
 
80 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  85.14 
 
 
84 aa  127  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  58.67 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  63.08 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  59.09 
 
 
87 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  54.55 
 
 
80 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  44.83 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  44 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  42.17 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  40.48 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  39.39 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  46.58 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  39.24 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  40.54 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  42.47 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  44.59 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  44.44 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  46.58 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  31.51 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  40 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  41.89 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0259  glutaredoxin 2  47.3 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  42.86 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  41.33 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  42.11 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  32 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  37.84 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  42.25 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  39.19 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  36.62 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  42.31 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  34.21 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  35 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0666  glutaredoxin 2  39.02 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  31.94 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  40 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  33.33 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  37.1 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  38.81 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  32.81 
 
 
89 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  36.99 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  44.26 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  33.8 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  31.51 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  33.77 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  39.34 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  34.21 
 
 
90 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  33.78 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  36 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  40 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  40 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  33.78 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5697  glutaredoxin family protein  32.76 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.411683  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35557  predicted protein  30.26 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.356085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  32 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  37.74 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5290  glutaredoxin family protein  32.76 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.291889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5244  glutaredoxin family protein  32.76 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>