31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0111 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  100 
 
 		 84 aa  176  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  38.1 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  38.36 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  37.97 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  42.31 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  39.74 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  32.56 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  35.9 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  39.74 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  38.75 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  37.35 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  31.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  36 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  36.78 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  34.88 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  31.25 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  37.66 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  37.18 
 
 		 79 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  36.84 
 
 		 78 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  30.77 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  32.88 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  31.94 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  36.36 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  36.36 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  31.58 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  32.14 
 
 		 84 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>