42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1741 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  100 
 
 		 78 aa  160  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  84.42 
 
 		 92 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  81.82 
 
 		 79 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  79.49 
 
 		 79 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  80.52 
 
 		 79 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  80.52 
 
 		 79 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  79.49 
 
 		 78 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  76.62 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  73.08 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  71.79 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  76.79 
 
 		 58 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  52.63 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  50.7 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  45.07 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  47.89 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  49.3 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  47.14 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  49.25 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  46.48 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  45.95 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  44.59 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  45.21 
 
 		 83 aa  57  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  40.85 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  46.67 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  46.67 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  43.06 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  44.29 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  44.29 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  45.71 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  45.71 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  37.97 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.89 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  46.67 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  46.48 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  34.94 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  40 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  36.62 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>