51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2336 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  190  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  90 
 
 		 80 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  65.56 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  73.08 
 
 		 78 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  69.23 
 
 		 78 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  67.5 
 
 		 79 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  66.25 
 
 		 79 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  66.25 
 
 		 79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  66.25 
 
 		 79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  66.25 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  46.67 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  57.63 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  47.89 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  43.06 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  41.67 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  41.46 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  45.21 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  39.73 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  38.71 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  40.26 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  33.78 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  37.14 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  33.78 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  31.51 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  40.26 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  40.85 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  40.85 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  40.26 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5697  glutaredoxin family protein  39.34 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.411683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  34.72 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5290  glutaredoxin family protein  39.34 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.291889  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  43.33 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5244  glutaredoxin family protein  39.34 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5255  glutaredoxin family protein  36.07 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4830  glutaredoxin family protein  39.34 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  40.28 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4820  glutaredoxin family protein  39.34 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  30.77 
 
 		 84 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4933  glutaredoxin 2  36.07 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  40.26 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4991  glutaredoxin family protein  40 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5226  glutaredoxin family protein  40 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5371  glutaredoxin family protein  40 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  35.82 
 
 		 75 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>