49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1852 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  168  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  84.81 
 
 		 79 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  83.54 
 
 		 79 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  86.08 
 
 		 79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  70 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  77.78 
 
 		 84 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  77.78 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  76.39 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  61.25 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  76.06 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  64 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  67.14 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  57.53 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  57.33 
 
 		 79 aa  91.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  57.33 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  54.05 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  44.59 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  48.65 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  49.28 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  50 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  47.83 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  45.07 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  45.83 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  43.06 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  45.07 
 
 		 92 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  42.47 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  46.48 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  36.78 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  36.11 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  35.53 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.1 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  34.78 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  47.92 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  36.84 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  48.15 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  34.67 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  32.94 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  30.38 
 
 		 384 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  32 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  32.43 
 
 		 383 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>