55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2469 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  100 
 
 		 78 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  62.82 
 
 		 78 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  62.82 
 
 		 79 aa  95.9  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  64.29 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  67.14 
 
 		 79 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  62.5 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  68.57 
 
 		 79 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  53.42 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  62.86 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  61.43 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  61.43 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  61.43 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  49.35 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  48.1 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  53.62 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  47.14 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  50.7 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  44.29 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  49.28 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  43.66 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  45.95 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  45.33 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  42.11 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  42.65 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  44 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  44 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  44.59 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  43.24 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  39.47 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  41.33 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  47.27 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  40.28 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  40.26 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  35.9 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  42.31 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  36.71 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  37.14 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.86 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  34.67 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  34.33 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18000  glutaredoxin 2  39.39 
 
 		 89 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  29.33 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  36.92 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  33.77 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  36 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  40 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  31.58 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  30.99 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>