31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1766 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  100 
 
 		 73 aa  147  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1264  glutaredoxin 2  56.94 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.605102  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  44.9 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  35.21 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  44.62 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  48.98 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  43.75 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  43.75 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  30.99 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  43.75 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  35.62 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  38.36 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  35.62 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  32.2 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  40.35 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  39.58 
 
 		 79 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 79 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  37.14 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  45.1 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  38.24 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  39.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  31.08 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  36 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  34.25 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  40 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  46.15 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  33.78 
 
 		 83 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  41.51 
 
 		 95 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>