39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01685 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  69.01 
 
 
75 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  40.79 
 
 
80 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  45.71 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  47.83 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  39.13 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  37.14 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  41.18 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  38.67 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  40.28 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  39.19 
 
 
80 aa  52  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  40.58 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  39.44 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  46.05 
 
 
78 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  39.71 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  37.33 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  38.57 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.24 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  41.43 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  39.13 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  37.68 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  37.66 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  38.46 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  38.46 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  40 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  40 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  33.77 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  39.71 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  40 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3258  glutaredoxin 2  37.18 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0632401  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  34.78 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  39.73 
 
 
81 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  40.28 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  36.99 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  39.68 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  26.32 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  45.28 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  36.62 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  36.36 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>