25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2106 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  87.93 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  76.79 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  74.14 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  78.18 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  72.41 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  72.41 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  73.21 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  71.43 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  61.02 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  57.63 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  62.22 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  45.28 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  51.02 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  41.51 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  46.67 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  52.38 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  46 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  47.62 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  46.51 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02011  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin i  45.24 
 
 		 43 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0686532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  38.78 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  44.44 
 
 		 83 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.22 
 
 		 66 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  44.19 
 
 		 81 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>