47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1059 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  78.02 
 
 		 91 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  74.73 
 
 		 91 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  46.59 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  48.24 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  53.42 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  53.42 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  47.44 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  44.19 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  41.67 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  41.67 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  42.17 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  40.48 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  38.82 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  38.82 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  42.35 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  39.76 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  39.29 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  41.82 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  39.39 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  38.82 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  39.51 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  40 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  39.66 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0439  glutaredoxin 2  43.64 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.816624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  39.62 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  30.3 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  39.29 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  43.86 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  30.77 
 
 		 81 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  41.82 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  40.96 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  36.36 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  35.85 
 
 		 81 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  37.29 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  38.89 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  30.51 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  32.73 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  28.77 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  38.6 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>