39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0989 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  100 
 
 		 91 aa  191  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  92.31 
 
 		 91 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  74.73 
 
 		 91 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  50.57 
 
 		 92 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  52.94 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  53.42 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  52.05 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  45.24 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  47.37 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  44.83 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  44.05 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  42.05 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  42.05 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  42.05 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  42.05 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  42.53 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  42.05 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  44.83 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  41.67 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  41.67 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  40.96 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  45 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  41.98 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  33.9 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  43.64 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  31.33 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  26.09 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 87 aa  43.9  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  37.93 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  36.36 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  35.71 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  40.96 
 
 		 75 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  35.85 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  40.3 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  31.67 
 
 		 103 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>