38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2090 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2090  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2025  glutaredoxin 2  49.32 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.354828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  48.57 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  44.16 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0729  glutaredoxin 2  53.85 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  47.14 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  47.14 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  47.14 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  47.14 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  47.14 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  47.14 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  45.71 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  43.21 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  46.58 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  41.98 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  45.07 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  41.56 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  44.29 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  38.24 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  46.15 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  44.62 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  39.51 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  45.28 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  32.35 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  35.82 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  42.11 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  30.26 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  26.92 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  42.11 
 
 		 83 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  26.25 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  34.21 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  27.03 
 
 		 89 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>