108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0445 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  353  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  81.91 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  60.22 
 
 		 322 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  60.22 
 
 		 310 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  69.86 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  69.7 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  59.42 
 
 		 119 aa  95.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  56.63 
 
 		 304 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1440  hypothetical protein  73.68 
 
 		 79 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  38.66 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  38.66 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  38.4 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  47.37 
 
 		 307 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  47.37 
 
 		 307 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  32.69 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  47.37 
 
 		 307 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  47.37 
 
 		 307 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  32.69 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  47.37 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  46.58 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  46.58 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  46.58 
 
 		 282 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  46.58 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  46.58 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  46.58 
 
 		 306 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  46.58 
 
 		 100 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  46.58 
 
 		 306 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  47.37 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  46.05 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  44 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  44 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  44 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  44 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  44 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  45.21 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  45.21 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  45.21 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  46.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  46.05 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  40.66 
 
 		 319 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  44.74 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  35.48 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  47.06 
 
 		 72 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  44 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  44 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  45.21 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  45.21 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  38.83 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  32.05 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  38.83 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  32.05 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  38.24 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  38.24 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  43.06 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  31.97 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  43.06 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  34.62 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  31.97 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  44.59 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  36.63 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  33.85 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  39 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  43.28 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  39 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  46.15 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4152  hypothetical protein  81.82 
 
 		 80 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  38.54 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  41.1 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  39.44 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  30.61 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  36.84 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  44.62 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.13634 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  35.37 
 
 		 297 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  37.35 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  37.35 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  37.35 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  37.35 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  43.08 
 
 		 111 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0481  hypothetical protein  44.9 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  35.21 
 
 		 330 aa  45.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>