148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4282 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  100 
 
 
245 aa  507  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  99.56 
 
 
226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  80.17 
 
 
305 aa  417  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  77.46 
 
 
305 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  77.05 
 
 
320 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  58.54 
 
 
306 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  58.54 
 
 
306 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  58.54 
 
 
306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  58.54 
 
 
306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  58.54 
 
 
306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  58.54 
 
 
306 aa  305  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  58.54 
 
 
306 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  58.54 
 
 
306 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  58.54 
 
 
306 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  58.13 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  58.13 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  58.13 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  58.13 
 
 
306 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  57.72 
 
 
306 aa  299  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  57.26 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  57.26 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  57.26 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  57.26 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  57.26 
 
 
306 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  56.1 
 
 
306 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  57.32 
 
 
306 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  56.85 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  56.85 
 
 
307 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  56.85 
 
 
307 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  56.85 
 
 
307 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  56.85 
 
 
307 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  56.43 
 
 
307 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  57.74 
 
 
300 aa  294  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  57.85 
 
 
302 aa  294  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  56.43 
 
 
307 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  56.43 
 
 
307 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  56.43 
 
 
307 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  56.5 
 
 
306 aa  292  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  56.02 
 
 
307 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  53.25 
 
 
307 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  53.11 
 
 
307 aa  278  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  58.22 
 
 
289 aa  278  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  51.63 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  58.69 
 
 
220 aa  263  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  57.75 
 
 
282 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  77.7 
 
 
167 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  55.61 
 
 
262 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  43.37 
 
 
356 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  42.23 
 
 
319 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  42.23 
 
 
319 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  42.23 
 
 
319 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  43.98 
 
 
301 aa  177  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  73.64 
 
 
113 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  61.16 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  51.27 
 
 
176 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  51.27 
 
 
176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  39.75 
 
 
322 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  42.72 
 
 
304 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 
310 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  61.26 
 
 
171 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  53.44 
 
 
143 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  55.73 
 
 
132 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  55.73 
 
 
132 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  54.31 
 
 
128 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  31.76 
 
 
330 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  43.57 
 
 
145 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  51.49 
 
 
111 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  69.44 
 
 
132 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  34.52 
 
 
181 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  40.62 
 
 
128 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  38.46 
 
 
150 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  42.34 
 
 
113 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  46.46 
 
 
126 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  37.59 
 
 
145 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  40.54 
 
 
111 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  35.34 
 
 
145 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  64.06 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0503362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>