107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05997 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  98.86 
 
 
176 aa  362  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  90.41 
 
 
306 aa  283  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  90.41 
 
 
306 aa  283  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  90.41 
 
 
306 aa  283  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  89.8 
 
 
306 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  89.8 
 
 
306 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  90.41 
 
 
306 aa  281  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  90.41 
 
 
306 aa  280  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  89.12 
 
 
306 aa  280  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  89.12 
 
 
306 aa  280  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  89.12 
 
 
306 aa  280  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  89.12 
 
 
306 aa  280  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  89.12 
 
 
306 aa  280  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  89.12 
 
 
306 aa  280  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  89.8 
 
 
306 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  89.12 
 
 
306 aa  280  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  89.12 
 
 
306 aa  280  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  89.04 
 
 
306 aa  278  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  88.36 
 
 
220 aa  278  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  85.71 
 
 
306 aa  272  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  86.43 
 
 
300 aa  261  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  86.43 
 
 
302 aa  261  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  90.08 
 
 
132 aa  256  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  90.08 
 
 
132 aa  256  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  72.9 
 
 
307 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  72.26 
 
 
307 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  72.26 
 
 
307 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  72.26 
 
 
307 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  71.61 
 
 
307 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  71.61 
 
 
307 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  71.34 
 
 
307 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  71.34 
 
 
307 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  71.34 
 
 
307 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  71.34 
 
 
307 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  70.7 
 
 
307 aa  240  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  71.61 
 
 
307 aa  240  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  71.61 
 
 
307 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  88.19 
 
 
289 aa  239  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  70.97 
 
 
307 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  70.32 
 
 
307 aa  238  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  69.68 
 
 
307 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  73.91 
 
 
143 aa  227  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  89.38 
 
 
282 aa  216  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  71.65 
 
 
128 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  51.27 
 
 
245 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  51.27 
 
 
226 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  55.86 
 
 
305 aa  163  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  52.38 
 
 
307 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  52.38 
 
 
307 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  54.68 
 
 
145 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  68.75 
 
 
262 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
305 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  51.45 
 
 
167 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  63.54 
 
 
111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  50.75 
 
 
320 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  40.59 
 
 
356 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  47.75 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  36.96 
 
 
145 aa  91.3  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01501  hypothetical protein  48.51 
 
 
104 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  38.16 
 
 
319 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  38.16 
 
 
319 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  40.5 
 
 
128 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  35.51 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  53.73 
 
 
74 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  36.81 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  84.44 
 
 
46 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  32.7 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 
310 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  40.98 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  39.6 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01924  transposase  70.83 
 
 
48 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.195787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  39.64 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  39.55 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0342  putative transposase  78.57 
 
 
46 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01493  hypothetical protein  82.5 
 
 
40 aa  70.9  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  37.86 
 
 
304 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  39.09 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  39.09 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  39.09 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  39.09 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4868  hypothetical protein  39.09 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  31.97 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  29.82 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0173  putative transposase  36.45 
 
 
124 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00960783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  42.25 
 
 
74 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_002978  WD0947  IS5 family transposase  33.33 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1440  hypothetical protein  41.07 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  42.59 
 
 
74 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  38.98 
 
 
94 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>