151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2610 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
322 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  75.9 
 
 
310 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  58.78 
 
 
304 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  42.68 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  42.99 
 
 
319 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  42.99 
 
 
319 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  40.76 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  38.14 
 
 
306 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  37.78 
 
 
306 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  37.78 
 
 
306 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  37.78 
 
 
306 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  37.82 
 
 
306 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  37.78 
 
 
306 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  38.14 
 
 
306 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  38.14 
 
 
306 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  38.14 
 
 
306 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  37.82 
 
 
306 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  37.82 
 
 
306 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  37.82 
 
 
306 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  36.54 
 
 
306 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  45.32 
 
 
301 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  38.36 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  36.71 
 
 
307 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  36.71 
 
 
307 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  36.71 
 
 
307 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  36.71 
 
 
307 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  39.07 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  36.39 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  36.39 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  36.39 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  36.39 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  36.39 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  36.39 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  36.39 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  36.08 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  36.08 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  36.08 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  36.08 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  36.39 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  36.57 
 
 
300 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  36.08 
 
 
307 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  35.9 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  36.98 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  36.48 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  36.08 
 
 
307 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  36.08 
 
 
307 aa  195  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  35.76 
 
 
307 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  35.76 
 
 
307 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  35.76 
 
 
307 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  39.56 
 
 
282 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  36.08 
 
 
307 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  35.56 
 
 
306 aa  192  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  36.04 
 
 
307 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
305 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  39.74 
 
 
320 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  36.89 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  36.57 
 
 
307 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  38.46 
 
 
262 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  39.75 
 
 
245 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  35.55 
 
 
330 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  60.16 
 
 
136 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  38.94 
 
 
226 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  39.68 
 
 
198 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  60.75 
 
 
119 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  35.62 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  40.12 
 
 
171 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  60.22 
 
 
171 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  31.5 
 
 
289 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  43.51 
 
 
150 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3451  hypothetical protein  78.12 
 
 
137 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.125459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  43 
 
 
126 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0672  putative transposase IS4  28.21 
 
 
329 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  38.26 
 
 
167 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  54.29 
 
 
74 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  39.06 
 
 
132 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  35.37 
 
 
181 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  32.7 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  32.7 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  43.3 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  42.86 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  42.27 
 
 
108 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  37.98 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  34.06 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  34.06 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  55.36 
 
 
94 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  37.39 
 
 
113 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  32.62 
 
 
143 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  26.26 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  37.21 
 
 
145 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  37.69 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>