12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3451 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3451  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125459 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  78.12 
 
 		 322 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  71.88 
 
 		 310 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  53.12 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  42.19 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  44.12 
 
 		 330 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  40.62 
 
 		 356 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  40.68 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  32.86 
 
 		 319 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  53.49 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  43.08 
 
 		 319 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  43.08 
 
 		 319 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>