155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4125 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
319 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  84.95 
 
 
319 aa  564  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  84.95 
 
 
319 aa  564  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  59.87 
 
 
356 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  43.35 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  42.12 
 
 
307 aa  241  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  42.77 
 
 
307 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  42.02 
 
 
306 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  42.02 
 
 
306 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  42.02 
 
 
306 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  42.02 
 
 
306 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  41.69 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  41.69 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  41.69 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  41.69 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  41.42 
 
 
306 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  42.53 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  42.53 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  42.26 
 
 
306 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  42.26 
 
 
306 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  42.26 
 
 
306 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  42.96 
 
 
289 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  40.51 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  40.51 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  42.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  40.06 
 
 
307 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  40.06 
 
 
307 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  40.06 
 
 
307 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  40.06 
 
 
307 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  40.51 
 
 
307 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  40.51 
 
 
307 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  40.51 
 
 
307 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  39.87 
 
 
307 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  39.87 
 
 
307 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  39.87 
 
 
307 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  39.87 
 
 
307 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  39.87 
 
 
307 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  39.87 
 
 
307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  39.87 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  43.68 
 
 
282 aa  222  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  39.55 
 
 
307 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  41.03 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  39.03 
 
 
307 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  40.76 
 
 
322 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  39.55 
 
 
307 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  40.71 
 
 
306 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  40.66 
 
 
300 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  40.52 
 
 
302 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  39.81 
 
 
306 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  45.27 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  40.2 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  39.1 
 
 
305 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  40.13 
 
 
320 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  42.52 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  42.23 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  39.53 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
330 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  41.78 
 
 
226 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  41.2 
 
 
220 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  41.11 
 
 
198 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
171 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  39.2 
 
 
181 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  38.35 
 
 
132 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  28.83 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  40.97 
 
 
145 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  42.4 
 
 
150 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  44.03 
 
 
136 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  40.95 
 
 
126 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  39.58 
 
 
143 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  36.2 
 
 
176 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  36.81 
 
 
176 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  37.01 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0672  putative transposase IS4  27.7 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  36.59 
 
 
126 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  41.51 
 
 
119 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  38.81 
 
 
132 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  39.68 
 
 
128 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  38.81 
 
 
132 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  42.71 
 
 
100 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  34.4 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  22.15 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  32.8 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  39.47 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  21.5 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  21.5 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  21.5 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  21.5 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>