160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0276 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
319 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
319 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  84.95 
 
 
319 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  60.82 
 
 
356 aa  401  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  42.72 
 
 
310 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  41.16 
 
 
307 aa  235  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  41.37 
 
 
306 aa  235  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  41.37 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  41.37 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  41.37 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  41.48 
 
 
307 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  41.04 
 
 
306 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  41.04 
 
 
306 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  41.04 
 
 
306 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  41.88 
 
 
306 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  41.88 
 
 
306 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  41.04 
 
 
306 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  40.38 
 
 
306 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  40.32 
 
 
307 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  40.32 
 
 
307 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  40.32 
 
 
307 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  40.32 
 
 
307 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  41.21 
 
 
306 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  41.21 
 
 
306 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  41.21 
 
 
306 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  40.51 
 
 
307 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  40.51 
 
 
307 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  40.13 
 
 
307 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  40.13 
 
 
307 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  40.13 
 
 
307 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  40.13 
 
 
307 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  40.13 
 
 
307 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  40.82 
 
 
307 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  40.13 
 
 
307 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  40.13 
 
 
307 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  39.81 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  42.61 
 
 
289 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  39.81 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  40.51 
 
 
307 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  40.51 
 
 
307 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  41.48 
 
 
306 aa  226  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  40.51 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  42.99 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  39.81 
 
 
307 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  43.32 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  40.38 
 
 
306 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  40.06 
 
 
306 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  40.72 
 
 
302 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  40.07 
 
 
305 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  47.62 
 
 
304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  40.52 
 
 
300 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  39.62 
 
 
306 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  39.1 
 
 
305 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
301 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  40.13 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  42.23 
 
 
245 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  39.84 
 
 
262 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  35.74 
 
 
330 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  41.78 
 
 
226 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  40.74 
 
 
220 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  41.34 
 
 
198 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
171 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  39.77 
 
 
181 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  29.67 
 
 
289 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  47.01 
 
 
136 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0672  putative transposase IS4  32.01 
 
 
329 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  42.42 
 
 
150 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  41.13 
 
 
145 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  41.9 
 
 
126 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  39.86 
 
 
143 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  36.84 
 
 
132 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  38.16 
 
 
176 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  38.16 
 
 
176 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  37.34 
 
 
167 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  36.22 
 
 
145 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
128 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  42.45 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  38.81 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  38.81 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  38.93 
 
 
128 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  34.96 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  35.2 
 
 
145 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  38.66 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  35.4 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0173  putative transposase  41.12 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00960783  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  41.05 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  22.3 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>