152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0892 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 310 aa  634    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  75.9 
 
 		 322 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  59 
 
 		 304 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  43.71 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  42.72 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  42.72 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  43.35 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  39.74 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  39.74 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  40.07 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  40.07 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  40.07 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  40.07 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  39.74 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  39.74 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  39.74 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  39.74 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  38.94 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  38.94 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  38.94 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  38.94 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  38.16 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  45.13 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  38.16 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  38.16 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  38.64 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  38.16 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  37.83 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  37.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  37.83 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  37.83 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  37.83 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  37.62 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  37.62 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  37.5 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  37.5 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  37.5 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  37.99 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  38.11 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  37.7 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  41.3 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  37.13 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  36.81 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  36.96 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  38.8 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  37.79 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  37.87 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  40 
 
 		 262 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  35.28 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  34.95 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  67.97 
 
 		 136 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  37.3 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  41.76 
 
 		 198 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  34.55 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  41.67 
 
 		 171 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  35.84 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  60.78 
 
 		 119 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  36.79 
 
 		 220 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  60.22 
 
 		 171 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  30.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  45.08 
 
 		 150 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  43 
 
 		 126 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3451  hypothetical protein  71.88 
 
 		 137 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  46 
 
 		 100 aa  89  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  36.42 
 
 		 167 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  36.72 
 
 		 181 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  44.33 
 
 		 176 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  55.88 
 
 		 74 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  38.28 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  32.69 
 
 		 176 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  32.69 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0672  putative transposase IS4  26.84 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  39.62 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0102  hypothetical protein  46.58 
 
 		 104 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2016  hypothetical protein  46.58 
 
 		 104 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0244839  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4849  hypothetical protein  46.58 
 
 		 104 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1697  hypothetical protein  45.21 
 
 		 104 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0652022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4413  hypothetical protein  45.21 
 
 		 104 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4439  hypothetical protein  45.21 
 
 		 104 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4869  hypothetical protein  45.21 
 
 		 104 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4890  hypothetical protein  45.21 
 
 		 104 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.815431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>