145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4306 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  99.56 
 
 
245 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  100 
 
 
226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  80.72 
 
 
305 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  76.89 
 
 
305 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  76.44 
 
 
320 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  57.71 
 
 
306 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  57.71 
 
 
306 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  57.71 
 
 
306 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  57.71 
 
 
306 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  57.71 
 
 
306 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  57.71 
 
 
306 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  57.71 
 
 
306 aa  275  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  57.71 
 
 
306 aa  275  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  57.71 
 
 
306 aa  275  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  57.27 
 
 
306 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  57.27 
 
 
306 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  57.27 
 
 
306 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  57.27 
 
 
306 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  56.83 
 
 
306 aa  272  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  57.27 
 
 
306 aa  271  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  57.47 
 
 
300 aa  271  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  56.31 
 
 
306 aa  268  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  55.07 
 
 
306 aa  268  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  56.31 
 
 
307 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  56.31 
 
 
307 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  56.31 
 
 
307 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  56.31 
 
 
307 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  55.86 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  56.95 
 
 
302 aa  265  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  55.86 
 
 
307 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  55.86 
 
 
307 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  55.86 
 
 
307 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  55.41 
 
 
307 aa  264  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  55.51 
 
 
306 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  58.69 
 
 
220 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  55.41 
 
 
307 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  55.41 
 
 
307 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  55.41 
 
 
307 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  53.74 
 
 
307 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  54.95 
 
 
307 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  52.7 
 
 
307 aa  255  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  51.98 
 
 
307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  57.28 
 
 
289 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  77.7 
 
 
167 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  56.7 
 
 
282 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  54.17 
 
 
262 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  42.11 
 
 
356 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  73.64 
 
 
113 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  41.78 
 
 
319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  41.78 
 
 
319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  51.27 
 
 
176 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  51.27 
 
 
176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  41.78 
 
 
319 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  41.92 
 
 
301 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  53.44 
 
 
143 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  55.73 
 
 
132 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  55.73 
 
 
132 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  38.94 
 
 
322 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  42.05 
 
 
304 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  35.84 
 
 
310 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  59.8 
 
 
198 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  54.31 
 
 
128 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  59.78 
 
 
171 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  43.57 
 
 
145 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  51.49 
 
 
111 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  30.42 
 
 
330 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  34.52 
 
 
181 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  40.62 
 
 
128 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  38.17 
 
 
150 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  42.34 
 
 
113 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  37.59 
 
 
145 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  40.54 
 
 
111 aa  88.2  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  35.34 
 
 
145 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  64.06 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  45.68 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  44.09 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  44.09 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2245  transposase, IS4 family protein  82.98 
 
 
49 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  66.04 
 
 
132 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  37.12 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  27.6 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>