99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3109 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  100 
 
 
145 aa  302  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  61.27 
 
 
307 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  61.27 
 
 
307 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  58.04 
 
 
306 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  58.04 
 
 
306 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  58.04 
 
 
306 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  58.04 
 
 
306 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  58.87 
 
 
306 aa  167  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  58.87 
 
 
306 aa  167  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  58.87 
 
 
306 aa  167  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  58.87 
 
 
306 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  58.87 
 
 
306 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  58.87 
 
 
306 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  58.87 
 
 
306 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  58.87 
 
 
306 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  58.04 
 
 
220 aa  167  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  57.45 
 
 
306 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  56.64 
 
 
306 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  56.64 
 
 
306 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  59.12 
 
 
306 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  57.55 
 
 
307 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  57.55 
 
 
307 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  58.39 
 
 
306 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  57.66 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  56.83 
 
 
307 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  56.83 
 
 
307 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  56.83 
 
 
307 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  56.83 
 
 
307 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  56.83 
 
 
307 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  56.83 
 
 
307 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  56.12 
 
 
307 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  59.85 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  59.85 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  56.12 
 
 
307 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  56.83 
 
 
307 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  54.55 
 
 
306 aa  157  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  54.68 
 
 
176 aa  157  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  55.56 
 
 
143 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  56.62 
 
 
300 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  56.62 
 
 
302 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  53.96 
 
 
176 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  54.68 
 
 
307 aa  153  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  60.5 
 
 
289 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  57.85 
 
 
128 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  91.89 
 
 
74 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  57.94 
 
 
282 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  47.69 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  43.57 
 
 
245 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  43.57 
 
 
226 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  46.92 
 
 
305 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  42.14 
 
 
356 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  46.51 
 
 
320 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  44.88 
 
 
167 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  41.13 
 
 
319 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  41.13 
 
 
319 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  40.97 
 
 
319 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  51.81 
 
 
262 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  40.74 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  48.75 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  31.08 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  32.21 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  33.58 
 
 
310 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  30.87 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  34.55 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0342  putative transposase  64.29 
 
 
46 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  64.29 
 
 
46 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  30.71 
 
 
322 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  35.78 
 
 
301 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  33.64 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  38.54 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01924  transposase  51.06 
 
 
48 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.195787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01493  hypothetical protein  62.5 
 
 
40 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  40.78 
 
 
304 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  30.3 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  30.3 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01501  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  50 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  38.67 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3111  hypothetical protein  43.14 
 
 
75 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451869  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  28.79 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  28.79 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  28.79 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  28.79 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  28.1 
 
 
330 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  46.94 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4868  hypothetical protein  27.61 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  32.22 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>