89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3055 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  100 
 
 
74 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  91.89 
 
 
145 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  61.19 
 
 
307 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  61.19 
 
 
307 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  61.19 
 
 
307 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  61.19 
 
 
307 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  61.19 
 
 
307 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  61.19 
 
 
307 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  61.19 
 
 
307 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  61.19 
 
 
307 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  61.19 
 
 
306 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  57.75 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  57.75 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  59.7 
 
 
307 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  59.7 
 
 
307 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  57.75 
 
 
220 aa  90.5  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  59.7 
 
 
307 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  59.7 
 
 
306 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  58.21 
 
 
307 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  58.21 
 
 
307 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  57.75 
 
 
306 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  53.42 
 
 
307 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  56.34 
 
 
306 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  56.34 
 
 
306 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  53.42 
 
 
307 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  54.93 
 
 
306 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  53.73 
 
 
176 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  53.73 
 
 
176 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  54.55 
 
 
307 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  58.46 
 
 
300 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  58.46 
 
 
302 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  66.67 
 
 
289 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  48.39 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  44.26 
 
 
245 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  44.26 
 
 
226 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  44.78 
 
 
356 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  43.08 
 
 
319 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  43.08 
 
 
319 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  48.39 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0342  putative transposase  57.78 
 
 
46 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  44.78 
 
 
319 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  46.77 
 
 
320 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
305 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  45.16 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  59.52 
 
 
46 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  57.14 
 
 
282 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  40 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  41.38 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01924  transposase  47.83 
 
 
48 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.195787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01493  hypothetical protein  57.5 
 
 
40 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3111  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451869  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  58.06 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  46.94 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  47.83 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  40 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01501  hypothetical protein  31.51 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  32.79 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  53.33 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  53.33 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  45.71 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  45.71 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  45.71 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  45.71 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  54.84 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  42.86 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>