72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3504 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  79.37 
 
 		 74 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  69.7 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  68.66 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1440  hypothetical protein  73.68 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  55.36 
 
 		 322 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  54.24 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4152  hypothetical protein  81.82 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  42.37 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  42.37 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  40.68 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  40.68 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  40.32 
 
 		 306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  40.68 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  40.3 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  40 
 
 		 306 aa  48.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  40.32 
 
 		 306 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  40.3 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  38.67 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 304 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  38.98 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  40.3 
 
 		 307 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  38.98 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  40.68 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  46.43 
 
 		 319 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  46.43 
 
 		 319 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  42.59 
 
 		 302 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  42.59 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  39.39 
 
 		 307 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  39.39 
 
 		 307 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  35 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  35 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  46.43 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  44.83 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  44.83 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  48.21 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  37.29 
 
 		 245 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  37.29 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  42.86 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.19907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>