47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1440 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1440  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  73.68 
 
 
171 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  73.68 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  70.18 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  71.7 
 
 
74 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  57.14 
 
 
310 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  53.06 
 
 
322 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4152  hypothetical protein  78.79 
 
 
80 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  41.07 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  41.07 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  40.35 
 
 
306 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  40.35 
 
 
306 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  41.07 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  41.07 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  41.07 
 
 
220 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
128 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
307 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  40.35 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  40.35 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  40.35 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  40.35 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  40.35 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  40.35 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  40.35 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  41.07 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  41.07 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  41.07 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  41.07 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  41.07 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  41.07 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  39.29 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  41.07 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  41.07 
 
 
306 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>