178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2114 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  99.02 
 
 		 307 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  99.35 
 
 		 307 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  100 
 
 		 307 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  100 
 
 		 307 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  99.67 
 
 		 307 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  99.67 
 
 		 307 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  99.67 
 
 		 307 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  99.67 
 
 		 307 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  98.37 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  98.37 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  98.05 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  98.37 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  98.37 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  98.37 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  97.07 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  97.39 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  97.39 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  97.39 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  97.39 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  97.39 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  97.07 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  97.07 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  96.74 
 
 		 307 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  91.5 
 
 		 307 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  80.46 
 
 		 306 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  524  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  80.46 
 
 		 306 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  79.8 
 
 		 306 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  79.15 
 
 		 306 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  79.15 
 
 		 306 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  79.48 
 
 		 306 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  79.48 
 
 		 306 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  78.5 
 
 		 306 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  77.85 
 
 		 306 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  96.76 
 
 		 262 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  78.33 
 
 		 300 aa  497  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  78.48 
 
 		 302 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  78.75 
 
 		 289 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  79.12 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  59.42 
 
 		 307 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  59.42 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  96.76 
 
 		 198 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  80.75 
 
 		 220 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  56.48 
 
 		 305 aa  362  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  96.49 
 
 		 171 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  55.05 
 
 		 305 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  55.05 
 
 		 320 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  56.85 
 
 		 245 aa  295  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  97.12 
 
 		 143 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  55.86 
 
 		 226 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  94.53 
 
 		 128 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  42.12 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  71.34 
 
 		 176 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  72.26 
 
 		 176 aa  242  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  42.45 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  40.51 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  40.51 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  78.03 
 
 		 132 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  78.03 
 
 		 132 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  40.51 
 
 		 319 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  92.79 
 
 		 111 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  35.76 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  41.85 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  66.94 
 
 		 126 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  78.12 
 
 		 100 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  56.83 
 
 		 145 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  51.68 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  53.79 
 
 		 132 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  73.97 
 
 		 72 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  51.79 
 
 		 113 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  61.19 
 
 		 74 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  34.09 
 
 		 181 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  36.57 
 
 		 145 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  39.85 
 
 		 150 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  27.83 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  80.43 
 
 		 46 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  35.82 
 
 		 145 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  39.18 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01501  hypothetical protein  49.43 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>