97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6001 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  309  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  46.1 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  76.32 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7103  Transposase and inactivated derivatives IS5 family  66.67 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  38.52 
 
 		 305 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  38.52 
 
 		 305 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  43.51 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  45.08 
 
 		 310 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  38.17 
 
 		 226 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  38.46 
 
 		 245 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  42.42 
 
 		 319 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  42.42 
 
 		 319 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  41.54 
 
 		 356 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  39.83 
 
 		 301 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 		 320 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  43.7 
 
 		 319 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  37.4 
 
 		 307 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  43.8 
 
 		 304 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  40.6 
 
 		 307 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  34.07 
 
 		 307 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  40.6 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  39.85 
 
 		 307 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  39.85 
 
 		 307 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  39.85 
 
 		 307 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  39.85 
 
 		 307 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  37.3 
 
 		 302 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  38.35 
 
 		 262 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 		 306 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 		 306 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  87  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  87  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  87  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  87  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  87  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  87  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  37.3 
 
 		 306 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  37.3 
 
 		 300 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  36.51 
 
 		 306 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  39.85 
 
 		 307 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  37.9 
 
 		 306 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  36.51 
 
 		 306 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  37.3 
 
 		 306 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  37.1 
 
 		 282 aa  84.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  37.1 
 
 		 289 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  37.1 
 
 		 306 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  38.14 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  33.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  42.72 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  44.83 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0672  putative transposase IS4  36.73 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  38.27 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0247  transposase IS4 family protein  34.74 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00199299  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  84 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1278  transposase  48.84 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0526022  normal  0.0935273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3138  hypothetical protein  55.88 
 
 		 45 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.262195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4291  hypothetical protein  55.88 
 
 		 45 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0821919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  37.25 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0138  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 276 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.773027  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0551  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 276 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0766  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 276 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0793  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 276 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.87589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1222  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 276 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1164  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 276 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1182  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 276 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1378  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0948  transposase IS4 family protein  29.9 
 
 		 276 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.10326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0624  transposase, IS4 family protein  30.65 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>