89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0672 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0672  putative transposase IS4  100 
 
 		 329 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1304  hypothetical protein  87.86 
 
 		 143 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1278  transposase  85.71 
 
 		 129 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0526022  normal  0.0935273 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  31.52 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  32.01 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  32.01 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  28.21 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  25.95 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  26.71 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  23.28 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  23.28 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  23.28 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  24.33 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  26.84 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  24.33 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  24.33 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  24.33 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  24.33 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  23.28 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  23.28 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  23.28 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  23.95 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  23.95 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  23.95 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  23.95 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  27.7 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  22.9 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  23.41 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  22.9 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  23.41 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  22.9 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  22.9 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  22.9 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  23.95 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  23.57 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  23.57 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  23.57 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  23.57 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  23.57 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  29.71 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  22.52 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  23.64 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  22.52 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  23.64 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  23.41 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  23.33 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  23.33 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  23.57 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  22.52 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  23.53 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  26.21 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  22.35 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  21.97 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  22.14 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  21.76 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  26.59 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  28.96 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  26.34 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  36.73 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  26.42 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  23.37 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  25.56 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  25.56 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  25.56 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  25.56 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  24 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  23.13 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2343  transposase IS4 family protein  24.88 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  27.21 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  23.08 
 
 		 171 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_002978  WD0947  IS5 family transposase  25 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>