195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06678 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  99.67 
 
 
306 aa  634    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  99.35 
 
 
306 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  99.35 
 
 
306 aa  631  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  99.35 
 
 
306 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  99.35 
 
 
306 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  99.02 
 
 
306 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  98.04 
 
 
306 aa  623  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  97.39 
 
 
306 aa  618  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  97.39 
 
 
306 aa  618  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  97.39 
 
 
306 aa  618  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  95.42 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  95.42 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  93.79 
 
 
306 aa  600  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  92.46 
 
 
306 aa  597  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  92.46 
 
 
306 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  91.83 
 
 
306 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  98.95 
 
 
289 aa  587  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  91.64 
 
 
300 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  91.36 
 
 
302 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  99.26 
 
 
282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  81.11 
 
 
307 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  80.46 
 
 
307 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  80.78 
 
 
307 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  80.13 
 
 
307 aa  524  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  79.8 
 
 
307 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  79.8 
 
 
307 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  79.8 
 
 
307 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  79.8 
 
 
307 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  80.46 
 
 
307 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  79.8 
 
 
307 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  79.15 
 
 
307 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  79.48 
 
 
307 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  79.48 
 
 
307 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  80.13 
 
 
307 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  78.83 
 
 
307 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  76.87 
 
 
307 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  99.07 
 
 
220 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  78.14 
 
 
262 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  60.86 
 
 
307 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  60.86 
 
 
307 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  57.89 
 
 
305 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  56.21 
 
 
305 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  55.7 
 
 
320 aa  324  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  81.52 
 
 
198 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  58.54 
 
 
245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  79.53 
 
 
171 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  89.12 
 
 
176 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  89.12 
 
 
176 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  57.71 
 
 
226 aa  275  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  43.14 
 
 
356 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  79.14 
 
 
143 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  41.04 
 
 
319 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  41.04 
 
 
319 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  41.69 
 
 
319 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  39.74 
 
 
310 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  41.64 
 
 
301 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  76.56 
 
 
128 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  37.82 
 
 
322 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  44.07 
 
 
304 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  97.94 
 
 
100 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  75.61 
 
 
126 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  73.87 
 
 
111 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  58.87 
 
 
145 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  32.81 
 
 
330 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  54.36 
 
 
167 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  50.76 
 
 
132 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  84.72 
 
 
72 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  51.79 
 
 
113 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05900  hypothetical protein  93.75 
 
 
56 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00549  hypothetical protein  93.75 
 
 
56 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  57.75 
 
 
74 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  91.11 
 
 
46 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  37.9 
 
 
150 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01501  hypothetical protein  57.14 
 
 
104 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  39.06 
 
 
128 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  32.2 
 
 
181 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  43.75 
 
 
108 aa  86.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  41.75 
 
 
119 aa  85.9  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05652  hypothetical protein  92.68 
 
 
43 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>