104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00550 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  275  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  275  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  98.48 
 
 		 306 aa  274  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  98.48 
 
 		 306 aa  274  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  98.48 
 
 		 306 aa  274  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  97.73 
 
 		 306 aa  270  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  97.73 
 
 		 306 aa  270  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  97.73 
 
 		 306 aa  270  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  97.73 
 
 		 306 aa  270  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  97.73 
 
 		 306 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  97.73 
 
 		 306 aa  271  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  97.73 
 
 		 306 aa  270  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  97.73 
 
 		 306 aa  270  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  96.97 
 
 		 306 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  96.97 
 
 		 306 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  96.97 
 
 		 306 aa  269  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  96.21 
 
 		 220 aa  268  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  94.66 
 
 		 306 aa  264  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  94.66 
 
 		 306 aa  263  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  93.94 
 
 		 306 aa  261  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  92.42 
 
 		 306 aa  260  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  90.08 
 
 		 176 aa  257  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  90.08 
 
 		 176 aa  256  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  92 
 
 		 300 aa  248  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  92 
 
 		 302 aa  247  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  80.92 
 
 		 307 aa  229  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  228  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  228  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  228  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  96.43 
 
 		 289 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  228  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  228  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  80.15 
 
 		 307 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  79.39 
 
 		 307 aa  227  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  78.03 
 
 		 307 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  78.03 
 
 		 307 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  78.03 
 
 		 307 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  78.03 
 
 		 307 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  78.03 
 
 		 307 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  78.03 
 
 		 307 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  78.79 
 
 		 307 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  78.03 
 
 		 307 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  78.79 
 
 		 143 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  78.03 
 
 		 307 aa  224  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  77.27 
 
 		 307 aa  224  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  76.56 
 
 		 128 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  73.48 
 
 		 307 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  96.94 
 
 		 282 aa  202  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  59.85 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  58.91 
 
 		 305 aa  156  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  55.73 
 
 		 245 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  55.73 
 
 		 226 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  54.69 
 
 		 307 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  54.69 
 
 		 307 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  53.03 
 
 		 320 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  53.44 
 
 		 305 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  52.03 
 
 		 167 aa  121  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  73.61 
 
 		 262 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  70 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  51.79 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  41.79 
 
 		 356 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  57.75 
 
 		 74 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01501  hypothetical protein  58.33 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  91.11 
 
 		 46 aa  87  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  38.81 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  38.81 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01924  transposase  79.17 
 
 		 48 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.195787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  36.51 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  41.79 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0342  putative transposase  88.1 
 
 		 46 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  38.81 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  34.92 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  34.06 
 
 		 322 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 		 310 aa  74.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01493  hypothetical protein  90 
 
 		 40 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  40.38 
 
 		 301 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  38.68 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  44.95 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4414  hypothetical protein  39.6 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4438  hypothetical protein  39.6 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4292  transposase  37.74 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0846491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  38.83 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3091  hypothetical protein  37.62 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.741214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4296  hypothetical protein  37.62 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288997  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4889  hypothetical protein  37.62 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4923  hypothetical protein  37.62 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  38.37 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4868  hypothetical protein  37.62 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  46.48 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  30.23 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04731  hypothetical protein  65.12 
 
 		 38 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05905  hypothetical protein  65.12 
 
 		 38 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0173  putative transposase  37.62 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00960783  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  44.44 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  40.68 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>