81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4109 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4109  ISSpo9, transposase  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3040  ISSpo9, transposase  72.6 
 
 
136 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  69.86 
 
 
171 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3504  hypothetical protein  79.37 
 
 
94 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  54.29 
 
 
322 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  55.88 
 
 
310 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1440  hypothetical protein  71.7 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  58.7 
 
 
304 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4152  hypothetical protein  47.22 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2015  IS4 family transposase  42.19 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186594  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1696  IS4 family transposase  42.19 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0325478  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  44.44 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
306 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
306 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  44.44 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  44.44 
 
 
302 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  44.44 
 
 
220 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  44.44 
 
 
300 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  42.03 
 
 
319 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  50 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  42.03 
 
 
319 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  42.59 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  44.44 
 
 
319 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  47.62 
 
 
356 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  42.59 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  46.3 
 
 
307 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  43.64 
 
 
306 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  44.44 
 
 
307 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  42.59 
 
 
306 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  46.3 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  35.62 
 
 
305 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  39.73 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  38.89 
 
 
245 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  38.89 
 
 
226 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3111  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451869  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  45.28 
 
 
307 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  45.28 
 
 
307 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  46.94 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  39.73 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  39.73 
 
 
320 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 
301 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  51.28 
 
 
128 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  40.62 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  44.44 
 
 
307 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  44.44 
 
 
307 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  47.62 
 
 
289 aa  40  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>