76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0343 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  87.5 
 
 
306 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  87.5 
 
 
306 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  87.5 
 
 
306 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  87.5 
 
 
306 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  87.5 
 
 
306 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  86.11 
 
 
306 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  86.11 
 
 
306 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  86.11 
 
 
306 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  86.11 
 
 
306 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  86.11 
 
 
306 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  86.11 
 
 
306 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  86.11 
 
 
306 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  86.11 
 
 
282 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  86.11 
 
 
289 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  86.11 
 
 
100 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  84.72 
 
 
306 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  84.72 
 
 
306 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  84.72 
 
 
306 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  81.94 
 
 
306 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  81.94 
 
 
306 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  83.33 
 
 
302 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  81.94 
 
 
300 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  81.94 
 
 
306 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
198 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
262 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  75.34 
 
 
307 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  73.97 
 
 
307 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  73.97 
 
 
171 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  76.06 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  73.97 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  72.6 
 
 
307 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  56.94 
 
 
307 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  56.94 
 
 
307 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  53.42 
 
 
320 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  52.05 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05652  hypothetical protein  90.24 
 
 
43 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  54.79 
 
 
305 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00549  hypothetical protein  75 
 
 
56 aa  77  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05900  hypothetical protein  75 
 
 
56 aa  77  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  54.17 
 
 
305 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  52.05 
 
 
310 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  49.28 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4283  transposase  55.36 
 
 
56 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.901579  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  47.06 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  48.48 
 
 
304 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01492  hypothetical protein  77.78 
 
 
37 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  45.71 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  40.91 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 
330 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  41.18 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  42.25 
 
 
356 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  40.85 
 
 
301 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  39.44 
 
 
319 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  38.03 
 
 
319 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  38.03 
 
 
319 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>