74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4283 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4283  transposase  100 
 
 
56 aa  120  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.901579  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  69.64 
 
 
305 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  67.86 
 
 
305 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  67.86 
 
 
320 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  66.67 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  55.36 
 
 
307 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  55.36 
 
 
307 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  57.14 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  57.14 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  55.36 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  53.57 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  55.36 
 
 
306 aa  63.5  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  53.57 
 
 
306 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  53.57 
 
 
306 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  53.57 
 
 
306 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  53.57 
 
 
282 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  53.57 
 
 
306 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  53.57 
 
 
306 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  53.57 
 
 
306 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  51.79 
 
 
306 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  51.79 
 
 
306 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  51.79 
 
 
306 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  51.79 
 
 
306 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  53.57 
 
 
289 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  50 
 
 
306 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  50 
 
 
306 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  51.79 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  51.79 
 
 
302 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  51.79 
 
 
306 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  51.79 
 
 
306 aa  59.3  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  51.79 
 
 
306 aa  59.3  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
198 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  50 
 
 
307 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  46.43 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  50 
 
 
307 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  48.21 
 
 
171 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  48.21 
 
 
262 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  46.43 
 
 
307 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05652  hypothetical protein  52.38 
 
 
43 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
301 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  42.59 
 
 
319 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  50 
 
 
310 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01492  hypothetical protein  54.05 
 
 
37 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  46.3 
 
 
356 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
330 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  44.64 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  43.4 
 
 
322 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  40.38 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  40.74 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 
304 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 
319 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 
319 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0445  hypothetical protein  48 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>