16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1304 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1304  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0672  putative transposase IS4  87.86 
 
 		 329 aa  257  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  29.86 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  27.33 
 
 		 322 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  28.19 
 
 		 310 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  31.78 
 
 		 330 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  31.07 
 
 		 299 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  31.07 
 
 		 299 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  31.07 
 
 		 299 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  31.07 
 
 		 299 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  28.95 
 
 		 297 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2343  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  27.89 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  27.89 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  26.47 
 
 		 307 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  27.82 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>