70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1278 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1278  transposase  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0526022  normal  0.0935273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0672  putative transposase IS4  85.71 
 
 		 329 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  32.2 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  36.11 
 
 		 319 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  33.33 
 
 		 322 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  29.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  29.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  29.81 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  29.52 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  29.52 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  29.52 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  29.52 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  29.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  29.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  29.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  29.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  29.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  28.57 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  28.57 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  26.77 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  26.77 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  28.57 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 307 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  29.52 
 
 		 305 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  28.04 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  28.57 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  26.36 
 
 		 289 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  25.58 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  25.58 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  25.58 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  25.58 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  29.25 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  27.36 
 
 		 307 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  28.97 
 
 		 356 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  25.58 
 
 		 282 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  25.58 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  24.81 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  25.58 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  29 
 
 		 310 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  25.58 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  25.58 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  24.81 
 
 		 300 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  26.79 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  48.84 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  31.25 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 304 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  32.18 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  25.23 
 
 		 301 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>