100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0784 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0784  methyltransferase type 11  100 
 
 
132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  67.54 
 
 
165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1298  methyltransferase type 11  61.4 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0306  methyltransferase type 11  56.9 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  48 
 
 
194 aa  111  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  38.67 
 
 
248 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  38.67 
 
 
248 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  44.93 
 
 
324 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  37.33 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
248 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  44.93 
 
 
331 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.25 
 
 
325 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  41.1 
 
 
341 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  41.1 
 
 
332 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  41.1 
 
 
328 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  41.1 
 
 
328 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  41.1 
 
 
328 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.08 
 
 
251 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  41.1 
 
 
327 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
252 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  45.83 
 
 
256 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.46 
 
 
207 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  38.78 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  42.03 
 
 
320 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.83 
 
 
258 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  38.46 
 
 
207 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.93 
 
 
251 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.93 
 
 
251 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  38.78 
 
 
204 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  38.78 
 
 
173 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
220 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
187 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  35 
 
 
250 aa  43.9  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  43.14 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  48 
 
 
264 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
207 aa  43.5  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  35 
 
 
250 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
220 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
220 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
220 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.78 
 
 
256 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.55 
 
 
256 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
257 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.46 
 
 
256 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
253 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5641  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  36 
 
 
220 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
250 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.83 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  34.21 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.58 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
217 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
256 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.1 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  38.1 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.1 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.78 
 
 
256 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
255 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.1 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.1 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  38.1 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.1 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
235 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.78 
 
 
251 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 
262 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
199 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
235 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
256 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.78 
 
 
251 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.43 
 
 
258 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.78 
 
 
251 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.78 
 
 
251 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  34.94 
 
 
275 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2769  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
275 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.78 
 
 
251 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
204 aa  40.8  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  43.06 
 
 
305 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
258 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
241 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
348 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.82 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.82 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  40 
 
 
256 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  52.63 
 
 
264 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.82 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.82 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
206 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.33 
 
 
258 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.73 
 
 
207 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  30.14 
 
 
223 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  39.22 
 
 
253 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1499  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.45 
 
 
258 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  35.62 
 
 
258 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
253 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
204 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
204 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  48.94 
 
 
259 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  50 
 
 
429 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>