87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04233 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04233  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 267 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1226  uroporphyrinogen-III synthase  55.08 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1133  uroporphyrinogen-III synthase  55.08 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0764964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0131  uroporphyrinogen-III synthase  50.96 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0482  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.63 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2173  uroporphyrinogen-III synthase  26.88 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4134  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.44 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0008  uroporphyrinogen-III synthase  26.48 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0960218  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  31.64 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0073  uroporphyrinogen-III synthase  31.12 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0439  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.29 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.64 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002105  uroporphyrinogen-III synthase  29.84 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  40.71 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0372  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.69 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3588  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.07 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  32.33 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2162  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.9 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.96 
 
 		 672 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00315  uroporphyrinogen-III synthase  29.38 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0385  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  27.75 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0317  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.35 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.8019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3639  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  31.33 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0503  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.89 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  32.16 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  30.67 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0341  uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.53 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0657  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.15 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  31.58 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.54 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.92 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0219  uroporphyrinogen III synthase HemD  31.62 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4001  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.17 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.655634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  29.44 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  31.89 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3902  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.52 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  31.89 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0227  uroporphyrinogen-III synthase  30.14 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.67 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.843372  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3979  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.52 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4095  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.52 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  32.8 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.12 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0257  uroporphyrinogen-III synthase  33.55 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3255  uroporphyrinogen-III synthase  32.87 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0178  uroporphyrinogen-III synthase  29.21 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0118658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3641  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.28 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01291  putative uroporphyrinogen III synthase  22.62 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.414645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2399  uroporphyrinogen-III synthase  29.61 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.659823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2792  uroporphyrinogen-III synthetase  26.01 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0045  uroporphyrinogen-III synthase  25.64 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3666  Na+/H+ antiporter NhaA  30.41 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.232778  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4219  uroporphyrinogen-III synthase  32.22 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.374545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.84 
 
 		 702 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2661  uroporphyrinogen-III synthetase  27.06 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4267  uroporphyrinogen-III synthase  31.76 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4326  uroporphyrinogen-III synthase  31.76 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.975314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4150  uroporphyrinogen-III synthase  31.76 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4165  uroporphyrinogen-III synthase  31.76 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000285608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  28.57 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3988  uroporphyrinogen-III synthase  29.53 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.84 
 
 		 665 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.33 
 
 		 695 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47590  uroporphyrinogen-III synthase  31.43 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  27.36 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0281  uroporphyrinogen-III synthase  28.81 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  30.12 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00149  uroporphyrinogen-III synthetase  33.61 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4175  Uroporphyrinogen-III synthase  32 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.272222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5242  uroporphyrinogen-III synthase  30.95 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4024  uroporphyrinogen-III synthase  30.95 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3108  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4203  uroporphyrinogen-III synthase  31.2 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4319  uroporphyrinogen-III synthase  31.2 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0995416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4263  uroporphyrinogen-III synthase  27.08 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  30.3 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03628  hypothetical protein  31.2 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03679  uroporphyrinogen-III synthetase  31.2 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.398858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4017  uroporphyrinogen-III synthase  26.47 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0535  uroporphyrinogen-III synthase  26.47 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0197  uroporphyrinogen-III synthase  26.47 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00133341  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3001  uroporphyrinogen-III synthase  31.28 
 
 		 275 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00619435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4169  uroporphyrinogen-III synthase  26.39 
 
 		 246 aa  42  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.534441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>