41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1226 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1226  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1133  uroporphyrinogen-III synthase  98.85 
 
 		 260 aa  507  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0764964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04233  uroporphyrinogen-III synthase  53.82 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0131  uroporphyrinogen-III synthase  45.04 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00315  uroporphyrinogen-III synthase  28.15 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2173  uroporphyrinogen-III synthase  25.82 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0008  uroporphyrinogen-III synthase  25.41 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0960218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.2 
 
 		 672 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002105  uroporphyrinogen-III synthase  27.57 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  32.54 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.35 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0129  uroporphyrinogen-III synthetase  29.88 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0482  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0385  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.21 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0317  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.21 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3588  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.17 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.21 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.8019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3639  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.21 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0372  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.61 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3902  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.89 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2792  uroporphyrinogen-III synthetase  27.33 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  29.88 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  26.02 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47590  uroporphyrinogen-III synthase  26.56 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2661  uroporphyrinogen-III synthetase  25.11 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  29.03 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3979  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.89 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4001  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.89 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.655634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0061  uroporphyrinogen-III synthase  28.63 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  27.12 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  29.88 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0073  uroporphyrinogen-III synthase  32.74 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  27.04 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  27.18 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2162  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.16 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0219  uroporphyrinogen III synthase HemD  24.74 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  21 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4095  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.35 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  26.15 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0062  uroporphyrinogen-III synthase  27.37 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0257  uroporphyrinogen-III synthase  38.1 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.835101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>