More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2593 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  56.48 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  58.03 
 
 		 316 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  58.86 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  58.03 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  51.34 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  36.79 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  39.07 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  37.46 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.42 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  36.49 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  37.34 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  35.33 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  34.41 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 		 335 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  34.08 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  36.71 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  36.45 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  37.07 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  32.37 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  35.91 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  36.64 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 		 312 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  31.94 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  31.94 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  31.94 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  31.94 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  33.44 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  35.17 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  35.51 
 
 		 350 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  35.87 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  36.27 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  34.67 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  34.67 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  34.46 
 
 		 314 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  29.69 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  30.31 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  33.56 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.62 
 
 		 356 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  38.16 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  32.48 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.6 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  30.66 
 
 		 354 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  33.88 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  29.84 
 
 		 369 aa  139  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  28.85 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  32.77 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  32.61 
 
 		 362 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  32.59 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  27.85 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  32.59 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.81 
 
 		 694 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  27.13 
 
 		 664 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  27.66 
 
 		 354 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  27.87 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  27.78 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  25.26 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  27.56 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  23.02 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  26.92 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  24.21 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  27.76 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  25.62 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  38.52 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  22.66 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  24.36 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  28.81 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  31.25 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  27.72 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  27.56 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  27.95 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  21.57 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  24.04 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.22 
 
 		 704 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  24.25 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  24.04 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  29.53 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.22 
 
 		 696 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.22 
 
 		 702 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.22 
 
 		 696 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  27.52 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.22 
 
 		 696 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  29.85 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>